Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Lrriq1Q0P5X1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Lrriq1Q0P5X1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Lrriq1Q0P5X1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Lrriq1Q0P5X1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Lrriq1Q0P5X1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Lrriq1Q0P5X1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.81
Lrriq1Q0P5X1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Lrriq1Q0P5X1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Lrriq1Q0P5X1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Lrriq1Q0P5X1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Lrriq1Q0P5X1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Lrriq1Q0P5X1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Lrriq1Q0P5X1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Lrriq1Q0P5X1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Lrriq1Q0P5X1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Lrriq1Q0P5X1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Lrriq1Q0P5X1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Lrriq1Q0P5X1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Lrriq1Q0P5X1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Lrriq1Q0P5X1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Lrriq1Q0P5X1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Lrriq1Q0P5X1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Lrriq1Q0P5X1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Lrriq1Q0P5X1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Lrriq1Q0P5X1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Lrriq1Q0P5X1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Lrriq1Q0P5X1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Lrriq1Q0P5X1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Lrriq1Q0P5X1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Lrriq1Q0P5X1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Lrriq1Q0P5X1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Lrriq1Q0P5X1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Lrriq1Q0P5X1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Lrriq1Q0P5X1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Lrriq1Q0P5X1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Lrriq1Q0P5X1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Lrriq1Q0P5X1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Lrriq1Q0P5X1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Lrriq1Q0P5X1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Lrriq1Q0P5X1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Lrriq1Q0P5X1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Lrriq1Q0P5X1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Lrriq1Q0P5X1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Lrriq1Q0P5X1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Lrriq1Q0P5X1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Lrriq1Q0P5X1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Lrriq1Q0P5X1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Lrriq1Q0P5X1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Lrriq1Q0P5X1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Lrriq1Q0P5X1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Lrriq1Q0P5X1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Lrriq1Q0P5X1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Lrriq1Q0P5X1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Lrriq1Q0P5X1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Lrriq1Q0P5X1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Lrriq1Q0P5X1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.81
Lrriq1Q0P5X1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Lrriq1Q0P5X1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Lrriq1Q0P5X1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Lrriq1Q0P5X1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Lrriq1Q0P5X1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Lrriq1Q0P5X1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Lrriq1Q0P5X1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Lrriq1Q0P5X1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Lrriq1Q0P5X1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Lrriq1Q0P5X1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Lrriq1Q0P5X1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Lrriq1Q0P5X1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Lrriq1Q0P5X1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Lrriq1Q0P5X1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Lrriq1Q0P5X1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Lrriq1Q0P5X1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Lrriq1Q0P5X1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Lrriq1Q0P5X1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Lrriq1Q0P5X1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Lrriq1Q0P5X1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Lrriq1Q0P5X1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Lrriq1Q0P5X1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Lrriq1Q0P5X1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Lrriq1Q0P5X1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Lrriq1Q0P5X1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Lrriq1Q0P5X1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Lrriq1Q0P5X1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Lrriq1Q0P5X1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Lrriq1Q0P5X1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Lrriq1Q0P5X1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Lrriq1Q0P5X1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Lrriq1Q0P5X1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Lrriq1Q0P5X1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Lrriq1Q0P5X1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Lrriq1Q0P5X1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Lrriq1Q0P5X1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Lrriq1Q0P5X1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Lrriq1Q0P5X1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Lrriq1Q0P5X1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Lrriq1Q0P5X1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Lrriq1Q0P5X1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Lrriq1Q0P5X1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Lrriq1Q0P5X1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms