Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V2

Sobp, Sine oculis-binding protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SobpQ0P5V2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SobpQ0P5V2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SobpQ0P5V2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SobpQ0P5V2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SobpQ0P5V2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SobpQ0P5V2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SobpQ0P5V2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SobpQ0P5V2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SobpQ0P5V2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SobpQ0P5V2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SobpQ0P5V2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SobpQ0P5V2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SobpQ0P5V2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SobpQ0P5V2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SobpQ0P5V2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SobpQ0P5V2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SobpQ0P5V2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SobpQ0P5V2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SobpQ0P5V2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SobpQ0P5V2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SobpQ0P5V2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SobpQ0P5V2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SobpQ0P5V2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SobpQ0P5V2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SobpQ0P5V2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SobpQ0P5V2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SobpQ0P5V2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SobpQ0P5V2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SobpQ0P5V2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SobpQ0P5V2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SobpQ0P5V2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SobpQ0P5V2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SobpQ0P5V2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SobpQ0P5V2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SobpQ0P5V2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SobpQ0P5V2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SobpQ0P5V2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SobpQ0P5V2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SobpQ0P5V2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SobpQ0P5V2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SobpQ0P5V2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SobpQ0P5V2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SobpQ0P5V2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SobpQ0P5V2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SobpQ0P5V2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SobpQ0P5V2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SobpQ0P5V2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SobpQ0P5V2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SobpQ0P5V2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SobpQ0P5V2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SobpQ0P5V2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SobpQ0P5V2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SobpQ0P5V2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SobpQ0P5V2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SobpQ0P5V2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SobpQ0P5V2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SobpQ0P5V2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SobpQ0P5V2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SobpQ0P5V2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SobpQ0P5V2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SobpQ0P5V2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SobpQ0P5V2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SobpQ0P5V2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SobpQ0P5V2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SobpQ0P5V2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SobpQ0P5V2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SobpQ0P5V2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SobpQ0P5V2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SobpQ0P5V2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SobpQ0P5V2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SobpQ0P5V2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SobpQ0P5V2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SobpQ0P5V2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SobpQ0P5V2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SobpQ0P5V2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SobpQ0P5V2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SobpQ0P5V2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SobpQ0P5V2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SobpQ0P5V2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SobpQ0P5V2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SobpQ0P5V2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SobpQ0P5V2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SobpQ0P5V2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SobpQ0P5V2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SobpQ0P5V2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SobpQ0P5V2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SobpQ0P5V2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SobpQ0P5V2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SobpQ0P5V2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SobpQ0P5V2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SobpQ0P5V2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SobpQ0P5V2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SobpQ0P5V2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SobpQ0P5V2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SobpQ0P5V2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SobpQ0P5V2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SobpQ0P5V2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SobpQ0P5V2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SobpQ0P5V2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SobpQ0P5V2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms