Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Neurl1bQ0MW30 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Neurl1bQ0MW30 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Neurl1bQ0MW30 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Neurl1bQ0MW30 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Neurl1bQ0MW30 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Neurl1bQ0MW30 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Neurl1bQ0MW30 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Neurl1bQ0MW30 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Neurl1bQ0MW30 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Neurl1bQ0MW30 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Neurl1bQ0MW30 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Neurl1bQ0MW30 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Neurl1bQ0MW30 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Neurl1bQ0MW30 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Neurl1bQ0MW30 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Neurl1bQ0MW30 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Neurl1bQ0MW30 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Neurl1bQ0MW30 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Neurl1bQ0MW30 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Neurl1bQ0MW30 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Neurl1bQ0MW30 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Neurl1bQ0MW30 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Neurl1bQ0MW30 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Neurl1bQ0MW30 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Neurl1bQ0MW30 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Neurl1bQ0MW30 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Neurl1bQ0MW30 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Neurl1bQ0MW30 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Neurl1bQ0MW30 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Neurl1bQ0MW30 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Neurl1bQ0MW30 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Neurl1bQ0MW30 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Neurl1bQ0MW30 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Neurl1bQ0MW30 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Neurl1bQ0MW30 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Neurl1bQ0MW30 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Neurl1bQ0MW30 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Neurl1bQ0MW30 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Neurl1bQ0MW30 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Neurl1bQ0MW30 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neurl1bQ0MW30 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neurl1bQ0MW30 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neurl1bQ0MW30 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neurl1bQ0MW30 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neurl1bQ0MW30 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neurl1bQ0MW30 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Neurl1bQ0MW30 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Neurl1bQ0MW30 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Neurl1bQ0MW30 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Neurl1bQ0MW30 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Neurl1bQ0MW30 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Neurl1bQ0MW30 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Neurl1bQ0MW30 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Neurl1bQ0MW30 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Neurl1bQ0MW30 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Neurl1bQ0MW30 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Neurl1bQ0MW30 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Neurl1bQ0MW30 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Neurl1bQ0MW30 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Neurl1bQ0MW30 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Neurl1bQ0MW30 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Neurl1bQ0MW30 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Neurl1bQ0MW30 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Neurl1bQ0MW30 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Neurl1bQ0MW30 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Neurl1bQ0MW30 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Neurl1bQ0MW30 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Neurl1bQ0MW30 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Neurl1bQ0MW30 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Neurl1bQ0MW30 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Neurl1bQ0MW30 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Neurl1bQ0MW30 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Neurl1bQ0MW30 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Neurl1bQ0MW30 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Neurl1bQ0MW30 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Neurl1bQ0MW30 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Neurl1bQ0MW30 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Neurl1bQ0MW30 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Neurl1bQ0MW30 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Neurl1bQ0MW30 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Neurl1bQ0MW30 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Neurl1bQ0MW30 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Neurl1bQ0MW30 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Neurl1bQ0MW30 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Neurl1bQ0MW30 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Neurl1bQ0MW30 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Neurl1bQ0MW30 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Neurl1bQ0MW30 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Neurl1bQ0MW30 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Neurl1bQ0MW30 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Neurl1bQ0MW30 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms