Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubxn2bQ0KL01 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubxn2bQ0KL01 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubxn2bQ0KL01 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubxn2bQ0KL01 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubxn2bQ0KL01 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubxn2bQ0KL01 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubxn2bQ0KL01 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubxn2bQ0KL01 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubxn2bQ0KL01 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubxn2bQ0KL01 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubxn2bQ0KL01 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubxn2bQ0KL01 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubxn2bQ0KL01 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubxn2bQ0KL01 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubxn2bQ0KL01 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubxn2bQ0KL01 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubxn2bQ0KL01 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubxn2bQ0KL01 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubxn2bQ0KL01 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubxn2bQ0KL01 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubxn2bQ0KL01 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubxn2bQ0KL01 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubxn2bQ0KL01 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubxn2bQ0KL01 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubxn2bQ0KL01 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubxn2bQ0KL01 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubxn2bQ0KL01 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubxn2bQ0KL01 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubxn2bQ0KL01 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubxn2bQ0KL01 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubxn2bQ0KL01 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubxn2bQ0KL01 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubxn2bQ0KL01 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubxn2bQ0KL01 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubxn2bQ0KL01 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubxn2bQ0KL01 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubxn2bQ0KL01 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubxn2bQ0KL01 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubxn2bQ0KL01 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubxn2bQ0KL01 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubxn2bQ0KL01 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubxn2bQ0KL01 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubxn2bQ0KL01 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubxn2bQ0KL01 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubxn2bQ0KL01 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubxn2bQ0KL01 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubxn2bQ0KL01 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubxn2bQ0KL01 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubxn2bQ0KL01 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubxn2bQ0KL01 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubxn2bQ0KL01 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubxn2bQ0KL01 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubxn2bQ0KL01 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubxn2bQ0KL01 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubxn2bQ0KL01 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubxn2bQ0KL01 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubxn2bQ0KL01 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubxn2bQ0KL01 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubxn2bQ0KL01 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubxn2bQ0KL01 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubxn2bQ0KL01 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubxn2bQ0KL01 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubxn2bQ0KL01 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubxn2bQ0KL01 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubxn2bQ0KL01 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubxn2bQ0KL01 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubxn2bQ0KL01 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubxn2bQ0KL01 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubxn2bQ0KL01 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubxn2bQ0KL01 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubxn2bQ0KL01 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubxn2bQ0KL01 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubxn2bQ0KL01 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubxn2bQ0KL01 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubxn2bQ0KL01 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubxn2bQ0KL01 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubxn2bQ0KL01 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubxn2bQ0KL01 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ubxn2bQ0KL01 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ubxn2bQ0KL01 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ubxn2bQ0KL01 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ubxn2bQ0KL01 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms