Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Znf541Q0GGX2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Znf541Q0GGX2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Znf541Q0GGX2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Znf541Q0GGX2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Znf541Q0GGX2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Znf541Q0GGX2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Znf541Q0GGX2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Znf541Q0GGX2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Znf541Q0GGX2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Znf541Q0GGX2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Znf541Q0GGX2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Znf541Q0GGX2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Znf541Q0GGX2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Znf541Q0GGX2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Znf541Q0GGX2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Znf541Q0GGX2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Znf541Q0GGX2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Znf541Q0GGX2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Znf541Q0GGX2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Znf541Q0GGX2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Znf541Q0GGX2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Znf541Q0GGX2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Znf541Q0GGX2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Znf541Q0GGX2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Znf541Q0GGX2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Znf541Q0GGX2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Znf541Q0GGX2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Znf541Q0GGX2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Znf541Q0GGX2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Znf541Q0GGX2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Znf541Q0GGX2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Znf541Q0GGX2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Znf541Q0GGX2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Znf541Q0GGX2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Znf541Q0GGX2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Znf541Q0GGX2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Znf541Q0GGX2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Znf541Q0GGX2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Znf541Q0GGX2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Znf541Q0GGX2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Znf541Q0GGX2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Znf541Q0GGX2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Znf541Q0GGX2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Znf541Q0GGX2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Znf541Q0GGX2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Znf541Q0GGX2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Znf541Q0GGX2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Znf541Q0GGX2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Znf541Q0GGX2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Znf541Q0GGX2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Znf541Q0GGX2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Znf541Q0GGX2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Znf541Q0GGX2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Znf541Q0GGX2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Znf541Q0GGX2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Znf541Q0GGX2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Znf541Q0GGX2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Znf541Q0GGX2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Znf541Q0GGX2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Znf541Q0GGX2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Znf541Q0GGX2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Znf541Q0GGX2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Znf541Q0GGX2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Znf541Q0GGX2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Znf541Q0GGX2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Znf541Q0GGX2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Znf541Q0GGX2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Znf541Q0GGX2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Znf541Q0GGX2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Znf541Q0GGX2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Znf541Q0GGX2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Znf541Q0GGX2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Znf541Q0GGX2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Znf541Q0GGX2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Znf541Q0GGX2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Znf541Q0GGX2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Znf541Q0GGX2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Znf541Q0GGX2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Znf541Q0GGX2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Znf541Q0GGX2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Znf541Q0GGX2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Znf541Q0GGX2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Znf541Q0GGX2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Znf541Q0GGX2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Znf541Q0GGX2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Znf541Q0GGX2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Znf541Q0GGX2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Znf541Q0GGX2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Znf541Q0GGX2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Znf541Q0GGX2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Znf541Q0GGX2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Znf541Q0GGX2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Znf541Q0GGX2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Znf541Q0GGX2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Znf541Q0GGX2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Znf541Q0GGX2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Znf541Q0GGX2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Znf541Q0GGX2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Znf541Q0GGX2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms