Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms