Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rbp2Q08652 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms