Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms