Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnn1Q08091 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms