Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pou6f1Q07916 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pou6f1Q07916 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pou6f1Q07916 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pou6f1Q07916 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pou6f1Q07916 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pou6f1Q07916 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pou6f1Q07916 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pou6f1Q07916 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pou6f1Q07916 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pou6f1Q07916 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pou6f1Q07916 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms