Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms