Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sox8Q04886 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms