Protein–RNA interactions for Protein: Q04742

Emx1, Homeobox protein EMX1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx1Q04742 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Emx1Q04742 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Emx1Q04742 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Emx1Q04742 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Emx1Q04742 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Emx1Q04742 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Emx1Q04742 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Emx1Q04742 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Emx1Q04742 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Emx1Q04742 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Emx1Q04742 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Emx1Q04742 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Emx1Q04742 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Emx1Q04742 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Emx1Q04742 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Emx1Q04742 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Emx1Q04742 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Emx1Q04742 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Emx1Q04742 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Emx1Q04742 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Emx1Q04742 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Emx1Q04742 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Emx1Q04742 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Emx1Q04742 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Emx1Q04742 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Emx1Q04742 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Emx1Q04742 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Emx1Q04742 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Emx1Q04742 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Emx1Q04742 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Emx1Q04742 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Emx1Q04742 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Emx1Q04742 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Emx1Q04742 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Emx1Q04742 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Emx1Q04742 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Emx1Q04742 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Emx1Q04742 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Emx1Q04742 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Emx1Q04742 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms