Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccl7Q03366 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms