Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pdcd1Q02242 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdcd1Q02242 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdcd1Q02242 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdcd1Q02242 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdcd1Q02242 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdcd1Q02242 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdcd1Q02242 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdcd1Q02242 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdcd1Q02242 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdcd1Q02242 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdcd1Q02242 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdcd1Q02242 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdcd1Q02242 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 207.6 ms