Protein–RNA interactions for Protein: Q01965

Ly9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly9Q01965 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms