Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RykQ01887 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RykQ01887 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RykQ01887 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RykQ01887 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RykQ01887 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RykQ01887 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RykQ01887 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RykQ01887 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RykQ01887 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RykQ01887 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RykQ01887 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RykQ01887 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RykQ01887 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RykQ01887 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RykQ01887 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RykQ01887 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RykQ01887 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RykQ01887 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RykQ01887 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RykQ01887 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RykQ01887 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RykQ01887 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RykQ01887 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RykQ01887 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RykQ01887 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RykQ01887 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RykQ01887 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RykQ01887 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RykQ01887 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RykQ01887 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RykQ01887 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RykQ01887 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RykQ01887 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RykQ01887 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RykQ01887 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RykQ01887 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RykQ01887 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RykQ01887 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RykQ01887 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RykQ01887 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RykQ01887 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RykQ01887 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RykQ01887 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RykQ01887 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RykQ01887 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RykQ01887 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RykQ01887 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RykQ01887 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RykQ01887 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RykQ01887 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RykQ01887 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RykQ01887 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RykQ01887 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RykQ01887 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RykQ01887 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RykQ01887 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RykQ01887 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RykQ01887 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RykQ01887 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RykQ01887 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RykQ01887 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RykQ01887 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RykQ01887 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RykQ01887 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RykQ01887 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RykQ01887 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RykQ01887 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RykQ01887 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RykQ01887 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RykQ01887 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RykQ01887 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RykQ01887 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RykQ01887 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RykQ01887 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RykQ01887 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RykQ01887 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RykQ01887 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RykQ01887 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RykQ01887 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RykQ01887 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RykQ01887 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RykQ01887 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RykQ01887 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RykQ01887 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RykQ01887 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RykQ01887 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RykQ01887 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RykQ01887 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RykQ01887 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RykQ01887 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RykQ01887 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RykQ01887 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RykQ01887 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RykQ01887 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RykQ01887 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RykQ01887 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RykQ01887 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RykQ01887 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RykQ01887 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms