Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms