Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cacna1cQ01815 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms