Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gbp1Q01514 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gbp1Q01514 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gbp1Q01514 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gbp1Q01514 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gbp1Q01514 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gbp1Q01514 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gbp1Q01514 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gbp1Q01514 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gbp1Q01514 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gbp1Q01514 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gbp1Q01514 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gbp1Q01514 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gbp1Q01514 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gbp1Q01514 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gbp1Q01514 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gbp1Q01514 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gbp1Q01514 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gbp1Q01514 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gbp1Q01514 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gbp1Q01514 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gbp1Q01514 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gbp1Q01514 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gbp1Q01514 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gbp1Q01514 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gbp1Q01514 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gbp1Q01514 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gbp1Q01514 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbp1Q01514 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbp1Q01514 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbp1Q01514 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbp1Q01514 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbp1Q01514 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbp1Q01514 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms