Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Top2aQ01320 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Top2aQ01320 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Top2aQ01320 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Top2aQ01320 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Top2aQ01320 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Top2aQ01320 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Top2aQ01320 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Top2aQ01320 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Top2aQ01320 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Top2aQ01320 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Top2aQ01320 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Top2aQ01320 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Top2aQ01320 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Top2aQ01320 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Top2aQ01320 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Top2aQ01320 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Top2aQ01320 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Top2aQ01320 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Top2aQ01320 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Top2aQ01320 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Top2aQ01320 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Top2aQ01320 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Top2aQ01320 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Top2aQ01320 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Top2aQ01320 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Top2aQ01320 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Top2aQ01320 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Top2aQ01320 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Top2aQ01320 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Top2aQ01320 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Top2aQ01320 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Top2aQ01320 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Top2aQ01320 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Top2aQ01320 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Top2aQ01320 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Top2aQ01320 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Top2aQ01320 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Top2aQ01320 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Top2aQ01320 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Top2aQ01320 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Top2aQ01320 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Top2aQ01320 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Top2aQ01320 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Top2aQ01320 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Top2aQ01320 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Top2aQ01320 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Top2aQ01320 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Top2aQ01320 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Top2aQ01320 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Top2aQ01320 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Top2aQ01320 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Top2aQ01320 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Top2aQ01320 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Top2aQ01320 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Top2aQ01320 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Top2aQ01320 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Top2aQ01320 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Top2aQ01320 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Top2aQ01320 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Top2aQ01320 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Top2aQ01320 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Top2aQ01320 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Top2aQ01320 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Top2aQ01320 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Top2aQ01320 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Top2aQ01320 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Top2aQ01320 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
Top2aQ01320 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Top2aQ01320 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Top2aQ01320 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Top2aQ01320 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Top2aQ01320 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Top2aQ01320 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Top2aQ01320 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Top2aQ01320 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Top2aQ01320 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Top2aQ01320 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Top2aQ01320 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Top2aQ01320 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Top2aQ01320 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Top2aQ01320 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Top2aQ01320 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Top2aQ01320 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Top2aQ01320 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Top2aQ01320 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Top2aQ01320 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Top2aQ01320 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Top2aQ01320 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Top2aQ01320 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Top2aQ01320 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Top2aQ01320 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Top2aQ01320 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Top2aQ01320 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Top2aQ01320 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Top2aQ01320 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Top2aQ01320 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Top2aQ01320 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Top2aQ01320 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Top2aQ01320 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms