Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EgfrQ01279 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EgfrQ01279 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EgfrQ01279 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EgfrQ01279 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EgfrQ01279 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EgfrQ01279 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
EgfrQ01279 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EgfrQ01279 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EgfrQ01279 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EgfrQ01279 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EgfrQ01279 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EgfrQ01279 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EgfrQ01279 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EgfrQ01279 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EgfrQ01279 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EgfrQ01279 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EgfrQ01279 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
EgfrQ01279 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EgfrQ01279 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EgfrQ01279 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EgfrQ01279 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EgfrQ01279 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EgfrQ01279 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EgfrQ01279 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EgfrQ01279 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EgfrQ01279 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EgfrQ01279 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EgfrQ01279 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EgfrQ01279 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EgfrQ01279 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EgfrQ01279 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EgfrQ01279 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EgfrQ01279 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24■■□□□ 1.43
EgfrQ01279 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EgfrQ01279 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EgfrQ01279 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EgfrQ01279 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EgfrQ01279 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EgfrQ01279 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EgfrQ01279 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms