Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VegfaQ00731 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VegfaQ00731 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VegfaQ00731 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VegfaQ00731 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VegfaQ00731 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VegfaQ00731 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VegfaQ00731 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VegfaQ00731 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VegfaQ00731 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VegfaQ00731 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VegfaQ00731 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VegfaQ00731 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VegfaQ00731 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VegfaQ00731 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VegfaQ00731 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VegfaQ00731 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VegfaQ00731 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VegfaQ00731 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VegfaQ00731 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VegfaQ00731 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VegfaQ00731 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VegfaQ00731 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VegfaQ00731 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VegfaQ00731 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VegfaQ00731 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VegfaQ00731 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VegfaQ00731 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VegfaQ00731 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VegfaQ00731 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VegfaQ00731 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VegfaQ00731 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VegfaQ00731 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VegfaQ00731 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VegfaQ00731 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms