Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms