Protein–RNA interactions for Protein: Q00547

Hmmr, Hyaluronan mediated motility receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmmrQ00547 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
HmmrQ00547 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HmmrQ00547 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HmmrQ00547 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HmmrQ00547 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HmmrQ00547 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HmmrQ00547 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HmmrQ00547 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HmmrQ00547 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HmmrQ00547 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HmmrQ00547 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HmmrQ00547 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HmmrQ00547 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HmmrQ00547 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HmmrQ00547 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HmmrQ00547 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HmmrQ00547 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HmmrQ00547 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HmmrQ00547 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HmmrQ00547 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HmmrQ00547 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HmmrQ00547 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HmmrQ00547 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HmmrQ00547 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HmmrQ00547 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HmmrQ00547 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HmmrQ00547 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HmmrQ00547 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HmmrQ00547 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HmmrQ00547 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms