Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gabpb1Q00420 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gabpb1Q00420 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gabpb1Q00420 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gabpb1Q00420 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gabpb1Q00420 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gabpb1Q00420 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gabpb1Q00420 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gabpb1Q00420 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gabpb1Q00420 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gabpb1Q00420 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gabpb1Q00420 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gabpb1Q00420 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gabpb1Q00420 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gabpb1Q00420 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gabpb1Q00420 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gabpb1Q00420 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gabpb1Q00420 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gabpb1Q00420 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gabpb1Q00420 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gabpb1Q00420 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gabpb1Q00420 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gabpb1Q00420 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms