Protein–RNA interactions for Protein: P99025

Gchfr, GTP cyclohydrolase 1 feedback regulatory protein, mousemouse

Predictions only

Length 84 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GchfrP99025 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GchfrP99025 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GchfrP99025 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GchfrP99025 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GchfrP99025 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GchfrP99025 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GchfrP99025 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GchfrP99025 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GchfrP99025 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GchfrP99025 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GchfrP99025 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GchfrP99025 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GchfrP99025 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GchfrP99025 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GchfrP99025 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GchfrP99025 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GchfrP99025 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GchfrP99025 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GchfrP99025 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GchfrP99025 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GchfrP99025 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GchfrP99025 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GchfrP99025 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GchfrP99025 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GchfrP99025 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GchfrP99025 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GchfrP99025 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GchfrP99025 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GchfrP99025 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GchfrP99025 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GchfrP99025 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GchfrP99025 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GchfrP99025 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GchfrP99025 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GchfrP99025 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GchfrP99025 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GchfrP99025 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GchfrP99025 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GchfrP99025 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GchfrP99025 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GchfrP99025 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GchfrP99025 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GchfrP99025 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GchfrP99025 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GchfrP99025 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GchfrP99025 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GchfrP99025 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GchfrP99025 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GchfrP99025 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GchfrP99025 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GchfrP99025 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GchfrP99025 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GchfrP99025 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GchfrP99025 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GchfrP99025 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GchfrP99025 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GchfrP99025 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GchfrP99025 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GchfrP99025 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GchfrP99025 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GchfrP99025 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GchfrP99025 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GchfrP99025 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms