Protein–RNA interactions for Protein: P98084

Apba2, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba2P98084 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Apba2P98084 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Apba2P98084 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Apba2P98084 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Apba2P98084 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Apba2P98084 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apba2P98084 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apba2P98084 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apba2P98084 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apba2P98084 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apba2P98084 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apba2P98084 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apba2P98084 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Apba2P98084 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apba2P98084 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apba2P98084 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apba2P98084 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apba2P98084 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apba2P98084 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apba2P98084 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apba2P98084 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apba2P98084 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apba2P98084 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apba2P98084 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apba2P98084 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apba2P98084 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Apba2P98084 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Apba2P98084 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Apba2P98084 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Apba2P98084 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Apba2P98084 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Apba2P98084 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Apba2P98084 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Apba2P98084 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Apba2P98084 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Apba2P98084 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Apba2P98084 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Apba2P98084 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Apba2P98084 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Apba2P98084 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Apba2P98084 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Apba2P98084 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Apba2P98084 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Apba2P98084 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Apba2P98084 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Apba2P98084 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Apba2P98084 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Apba2P98084 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Apba2P98084 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Apba2P98084 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Apba2P98084 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Apba2P98084 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Apba2P98084 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Apba2P98084 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apba2P98084 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apba2P98084 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apba2P98084 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apba2P98084 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Apba2P98084 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apba2P98084 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apba2P98084 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apba2P98084 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apba2P98084 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apba2P98084 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apba2P98084 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apba2P98084 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apba2P98084 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Apba2P98084 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apba2P98084 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Apba2P98084 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apba2P98084 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Apba2P98084 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Apba2P98084 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Apba2P98084 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Apba2P98084 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Apba2P98084 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Apba2P98084 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Apba2P98084 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Apba2P98084 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Apba2P98084 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Apba2P98084 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Apba2P98084 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Apba2P98084 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Apba2P98084 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Apba2P98084 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Apba2P98084 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Apba2P98084 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Apba2P98084 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Apba2P98084 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apba2P98084 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apba2P98084 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apba2P98084 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apba2P98084 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apba2P98084 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apba2P98084 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apba2P98084 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Apba2P98084 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apba2P98084 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apba2P98084 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apba2P98084 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms