Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scn1bP97952 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms