Protein–RNA interactions for Protein: P97868

Rbbp6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp6P97868 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rbbp6P97868 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rbbp6P97868 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rbbp6P97868 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rbbp6P97868 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rbbp6P97868 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rbbp6P97868 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rbbp6P97868 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rbbp6P97868 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rbbp6P97868 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rbbp6P97868 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rbbp6P97868 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rbbp6P97868 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rbbp6P97868 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rbbp6P97868 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Rbbp6P97868 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rbbp6P97868 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rbbp6P97868 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rbbp6P97868 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rbbp6P97868 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rbbp6P97868 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rbbp6P97868 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rbbp6P97868 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rbbp6P97868 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rbbp6P97868 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rbbp6P97868 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rbbp6P97868 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rbbp6P97868 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Rbbp6P97868 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbbp6P97868 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbbp6P97868 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbbp6P97868 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbbp6P97868 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbbp6P97868 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbbp6P97868 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbbp6P97868 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbbp6P97868 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbbp6P97868 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbbp6P97868 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbbp6P97868 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rbbp6P97868 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rbbp6P97868 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rbbp6P97868 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Rbbp6P97868 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rbbp6P97868 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms