Protein–RNA interactions for Protein: P97812

Ihh, Indian hedgehog protein, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IhhP97812 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IhhP97812 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IhhP97812 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IhhP97812 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
IhhP97812 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IhhP97812 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IhhP97812 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IhhP97812 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IhhP97812 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
IhhP97812 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IhhP97812 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IhhP97812 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IhhP97812 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IhhP97812 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IhhP97812 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IhhP97812 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IhhP97812 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IhhP97812 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IhhP97812 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IhhP97812 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IhhP97812 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IhhP97812 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IhhP97812 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IhhP97812 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IhhP97812 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IhhP97812 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IhhP97812 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IhhP97812 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IhhP97812 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IhhP97812 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IhhP97812 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IhhP97812 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IhhP97812 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IhhP97812 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IhhP97812 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IhhP97812 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
IhhP97812 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IhhP97812 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IhhP97812 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IhhP97812 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IhhP97812 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IhhP97812 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IhhP97812 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IhhP97812 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IhhP97812 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IhhP97812 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IhhP97812 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
IhhP97812 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IhhP97812 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IhhP97812 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IhhP97812 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IhhP97812 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IhhP97812 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IhhP97812 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IhhP97812 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IhhP97812 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
IhhP97812 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
IhhP97812 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IhhP97812 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IhhP97812 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IhhP97812 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IhhP97812 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IhhP97812 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IhhP97812 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IhhP97812 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IhhP97812 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IhhP97812 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IhhP97812 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IhhP97812 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
IhhP97812 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IhhP97812 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IhhP97812 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IhhP97812 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IhhP97812 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IhhP97812 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IhhP97812 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
IhhP97812 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IhhP97812 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IhhP97812 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IhhP97812 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IhhP97812 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IhhP97812 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IhhP97812 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IhhP97812 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IhhP97812 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IhhP97812 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IhhP97812 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IhhP97812 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IhhP97812 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IhhP97812 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IhhP97812 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IhhP97812 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IhhP97812 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IhhP97812 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IhhP97812 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IhhP97812 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IhhP97812 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IhhP97812 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
IhhP97812 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IhhP97812 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms