Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
AlkP97793 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
AlkP97793 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
AlkP97793 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
AlkP97793 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
AlkP97793 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
AlkP97793 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
AlkP97793 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
AlkP97793 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
AlkP97793 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
AlkP97793 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
AlkP97793 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
AlkP97793 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AlkP97793 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AlkP97793 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AlkP97793 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AlkP97793 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AlkP97793 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AlkP97793 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
AlkP97793 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
AlkP97793 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
AlkP97793 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AlkP97793 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
AlkP97793 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
AlkP97793 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
AlkP97793 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
AlkP97793 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
AlkP97793 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
AlkP97793 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
AlkP97793 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
AlkP97793 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
AlkP97793 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
AlkP97793 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
AlkP97793 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
AlkP97793 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
AlkP97793 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
AlkP97793 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
AlkP97793 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
AlkP97793 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
AlkP97793 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
AlkP97793 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
AlkP97793 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
AlkP97793 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
AlkP97793 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
AlkP97793 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
AlkP97793 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
AlkP97793 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
AlkP97793 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
AlkP97793 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
AlkP97793 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
AlkP97793 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
AlkP97793 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
AlkP97793 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
AlkP97793 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
AlkP97793 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
AlkP97793 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
AlkP97793 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
AlkP97793 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
AlkP97793 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
AlkP97793 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
AlkP97793 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
AlkP97793 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
AlkP97793 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
AlkP97793 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
AlkP97793 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
AlkP97793 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
AlkP97793 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
AlkP97793 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
AlkP97793 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
AlkP97793 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
AlkP97793 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
AlkP97793 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
AlkP97793 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
AlkP97793 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
AlkP97793 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
AlkP97793 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
AlkP97793 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
AlkP97793 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
AlkP97793 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
AlkP97793 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
AlkP97793 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
AlkP97793 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
AlkP97793 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
AlkP97793 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
AlkP97793 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
AlkP97793 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
AlkP97793 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
AlkP97793 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
AlkP97793 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
AlkP97793 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
AlkP97793 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
AlkP97793 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
AlkP97793 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
AlkP97793 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
AlkP97793 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
AlkP97793 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
AlkP97793 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
AlkP97793 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
AlkP97793 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
AlkP97793 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms