Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cited1P97769 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cited1P97769 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cited1P97769 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cited1P97769 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cited1P97769 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cited1P97769 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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