Protein–RNA interactions for Protein: P97464

Ext1, Exostosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ext1P97464 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ext1P97464 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ext1P97464 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ext1P97464 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ext1P97464 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ext1P97464 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ext1P97464 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ext1P97464 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ext1P97464 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ext1P97464 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ext1P97464 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ext1P97464 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ext1P97464 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ext1P97464 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ext1P97464 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ext1P97464 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ext1P97464 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ext1P97464 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ext1P97464 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ext1P97464 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ext1P97464 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ext1P97464 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ext1P97464 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ext1P97464 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ext1P97464 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ext1P97464 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ext1P97464 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ext1P97464 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms