Protein–RNA interactions for Protein: P97412

Lyst, Lysosomal-trafficking regulator, mousemouse

Predictions only

Length 3,788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LystP97412 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LystP97412 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LystP97412 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LystP97412 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LystP97412 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LystP97412 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LystP97412 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LystP97412 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LystP97412 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LystP97412 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LystP97412 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LystP97412 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LystP97412 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LystP97412 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LystP97412 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LystP97412 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LystP97412 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LystP97412 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LystP97412 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LystP97412 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LystP97412 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LystP97412 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
LystP97412 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.26
LystP97412 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LystP97412 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LystP97412 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LystP97412 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LystP97412 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LystP97412 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LystP97412 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LystP97412 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LystP97412 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LystP97412 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LystP97412 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LystP97412 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LystP97412 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LystP97412 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LystP97412 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LystP97412 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LystP97412 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LystP97412 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LystP97412 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LystP97412 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LystP97412 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LystP97412 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LystP97412 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LystP97412 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LystP97412 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LystP97412 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LystP97412 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LystP97412 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LystP97412 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LystP97412 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LystP97412 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LystP97412 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LystP97412 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LystP97412 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LystP97412 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LystP97412 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LystP97412 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LystP97412 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LystP97412 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LystP97412 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LystP97412 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LystP97412 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LystP97412 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LystP97412 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LystP97412 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LystP97412 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LystP97412 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LystP97412 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LystP97412 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LystP97412 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LystP97412 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LystP97412 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LystP97412 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LystP97412 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LystP97412 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LystP97412 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LystP97412 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LystP97412 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LystP97412 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LystP97412 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LystP97412 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LystP97412 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LystP97412 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LystP97412 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LystP97412 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LystP97412 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LystP97412 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LystP97412 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LystP97412 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LystP97412 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LystP97412 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LystP97412 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LystP97412 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LystP97412 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LystP97412 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LystP97412 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LystP97412 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms