Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rps3aP97351 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps3aP97351 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps3aP97351 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps3aP97351 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps3aP97351 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps3aP97351 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps3aP97351 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps3aP97351 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps3aP97351 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps3aP97351 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps3aP97351 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps3aP97351 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps3aP97351 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps3aP97351 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps3aP97351 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps3aP97351 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps3aP97351 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps3aP97351 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps3aP97351 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps3aP97351 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps3aP97351 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps3aP97351 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps3aP97351 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps3aP97351 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps3aP97351 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps3aP97351 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps3aP97351 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps3aP97351 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps3aP97351 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps3aP97351 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps3aP97351 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps3aP97351 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps3aP97351 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps3aP97351 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps3aP97351 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps3aP97351 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps3aP97351 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps3aP97351 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps3aP97351 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms