Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkp1P97350 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkp1P97350 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkp1P97350 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkp1P97350 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkp1P97350 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkp1P97350 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkp1P97350 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkp1P97350 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkp1P97350 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkp1P97350 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkp1P97350 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkp1P97350 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkp1P97350 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pkp1P97350 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pkp1P97350 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Pkp1P97350 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Pkp1P97350 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pkp1P97350 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pkp1P97350 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pkp1P97350 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pkp1P97350 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pkp1P97350 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pkp1P97350 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pkp1P97350 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pkp1P97350 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pkp1P97350 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pkp1P97350 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pkp1P97350 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pkp1P97350 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pkp1P97350 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pkp1P97350 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pkp1P97350 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pkp1P97350 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkp1P97350 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkp1P97350 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkp1P97350 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkp1P97350 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkp1P97350 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pkp1P97350 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pkp1P97350 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pkp1P97350 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pkp1P97350 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pkp1P97350 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pkp1P97350 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pkp1P97350 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pkp1P97350 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pkp1P97350 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pkp1P97350 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pkp1P97350 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkp1P97350 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkp1P97350 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkp1P97350 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkp1P97350 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkp1P97350 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkp1P97350 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkp1P97350 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkp1P97350 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkp1P97350 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkp1P97350 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkp1P97350 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkp1P97350 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkp1P97350 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pkp1P97350 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pkp1P97350 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pkp1P97350 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pkp1P97350 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pkp1P97350 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pkp1P97350 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pkp1P97350 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pkp1P97350 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pkp1P97350 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pkp1P97350 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pkp1P97350 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pkp1P97350 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pkp1P97350 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pkp1P97350 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkp1P97350 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkp1P97350 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkp1P97350 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkp1P97350 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkp1P97350 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkp1P97350 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkp1P97350 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkp1P97350 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkp1P97350 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkp1P97350 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkp1P97350 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkp1P97350 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkp1P97350 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkp1P97350 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkp1P97350 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkp1P97350 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkp1P97350 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pkp1P97350 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pkp1P97350 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pkp1P97350 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pkp1P97350 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pkp1P97350 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pkp1P97350 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms