Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Irx3P81067 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Irx3P81067 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Irx3P81067 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Irx3P81067 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Irx3P81067 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Irx3P81067 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Irx3P81067 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Irx3P81067 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Irx3P81067 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Irx3P81067 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Irx3P81067 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Irx3P81067 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Irx3P81067 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irx3P81067 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irx3P81067 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irx3P81067 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irx3P81067 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irx3P81067 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Irx3P81067 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irx3P81067 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irx3P81067 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irx3P81067 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irx3P81067 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irx3P81067 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Irx3P81067 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Irx3P81067 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Irx3P81067 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Irx3P81067 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Irx3P81067 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Irx3P81067 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Irx3P81067 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Irx3P81067 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Irx3P81067 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Irx3P81067 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Irx3P81067 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Irx3P81067 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Irx3P81067 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Irx3P81067 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Irx3P81067 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Irx3P81067 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Irx3P81067 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Irx3P81067 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Irx3P81067 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Irx3P81067 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Irx3P81067 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Irx3P81067 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Irx3P81067 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Irx3P81067 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Irx3P81067 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Irx3P81067 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Irx3P81067 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irx3P81067 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irx3P81067 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms