Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptprn2P80560 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptprn2P80560 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptprn2P80560 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptprn2P80560 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptprn2P80560 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptprn2P80560 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptprn2P80560 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptprn2P80560 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptprn2P80560 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptprn2P80560 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptprn2P80560 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptprn2P80560 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptprn2P80560 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptprn2P80560 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptprn2P80560 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
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Ptprn2P80560 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptprn2P80560 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptprn2P80560 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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Ptprn2P80560 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ptprn2P80560 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ptprn2P80560 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ptprn2P80560 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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Ptprn2P80560 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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Ptprn2P80560 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptprn2P80560 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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Ptprn2P80560 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptprn2P80560 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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Ptprn2P80560 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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Ptprn2P80560 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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Ptprn2P80560 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptprn2P80560 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptprn2P80560 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptprn2P80560 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptprn2P80560 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptprn2P80560 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptprn2P80560 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptprn2P80560 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
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Ptprn2P80560 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptprn2P80560 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ptprn2P80560 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
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Ptprn2P80560 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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Ptprn2P80560 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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Ptprn2P80560 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptprn2P80560 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptprn2P80560 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptprn2P80560 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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Ptprn2P80560 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptprn2P80560 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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Ptprn2P80560 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptprn2P80560 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptprn2P80560 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptprn2P80560 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptprn2P80560 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptprn2P80560 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptprn2P80560 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptprn2P80560 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptprn2P80560 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptprn2P80560 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptprn2P80560 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptprn2P80560 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptprn2P80560 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptprn2P80560 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptprn2P80560 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptprn2P80560 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptprn2P80560 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptprn2P80560 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptprn2P80560 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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