Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Otx1P80205 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Otx1P80205 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Otx1P80205 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Otx1P80205 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Otx1P80205 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Otx1P80205 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otx1P80205 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Otx1P80205 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms