Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CiitaP79621 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CiitaP79621 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CiitaP79621 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CiitaP79621 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CiitaP79621 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CiitaP79621 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CiitaP79621 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CiitaP79621 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CiitaP79621 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CiitaP79621 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CiitaP79621 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CiitaP79621 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CiitaP79621 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CiitaP79621 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CiitaP79621 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CiitaP79621 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CiitaP79621 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CiitaP79621 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CiitaP79621 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CiitaP79621 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CiitaP79621 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CiitaP79621 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CiitaP79621 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CiitaP79621 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CiitaP79621 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CiitaP79621 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CiitaP79621 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CiitaP79621 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CiitaP79621 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CiitaP79621 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CiitaP79621 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CiitaP79621 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CiitaP79621 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CiitaP79621 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CiitaP79621 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CiitaP79621 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CiitaP79621 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CiitaP79621 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CiitaP79621 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CiitaP79621 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CiitaP79621 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CiitaP79621 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CiitaP79621 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CiitaP79621 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CiitaP79621 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CiitaP79621 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CiitaP79621 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CiitaP79621 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CiitaP79621 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CiitaP79621 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CiitaP79621 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CiitaP79621 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CiitaP79621 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CiitaP79621 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CiitaP79621 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CiitaP79621 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CiitaP79621 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CiitaP79621 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CiitaP79621 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CiitaP79621 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CiitaP79621 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CiitaP79621 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CiitaP79621 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CiitaP79621 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CiitaP79621 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CiitaP79621 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CiitaP79621 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CiitaP79621 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CiitaP79621 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CiitaP79621 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CiitaP79621 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CiitaP79621 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CiitaP79621 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CiitaP79621 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CiitaP79621 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CiitaP79621 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CiitaP79621 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CiitaP79621 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CiitaP79621 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CiitaP79621 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CiitaP79621 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CiitaP79621 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CiitaP79621 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CiitaP79621 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CiitaP79621 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CiitaP79621 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CiitaP79621 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CiitaP79621 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CiitaP79621 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CiitaP79621 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CiitaP79621 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CiitaP79621 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CiitaP79621 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CiitaP79621 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CiitaP79621 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CiitaP79621 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CiitaP79621 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CiitaP79621 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CiitaP79621 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms