Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxb13P70321 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hoxb13P70321 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb13P70321 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb13P70321 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb13P70321 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb13P70321 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb13P70321 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb13P70321 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb13P70321 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb13P70321 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb13P70321 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb13P70321 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb13P70321 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb13P70321 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb13P70321 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb13P70321 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxb13P70321 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxb13P70321 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxb13P70321 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxb13P70321 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxb13P70321 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxb13P70321 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxb13P70321 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxb13P70321 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxb13P70321 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hoxb13P70321 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxb13P70321 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxb13P70321 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxb13P70321 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxb13P70321 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxb13P70321 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb13P70321 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb13P70321 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb13P70321 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb13P70321 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb13P70321 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb13P70321 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb13P70321 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb13P70321 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb13P70321 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxb13P70321 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxb13P70321 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxb13P70321 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxb13P70321 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Hoxb13P70321 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxb13P70321 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxb13P70321 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxb13P70321 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Hoxb13P70321 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxb13P70321 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxb13P70321 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxb13P70321 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxb13P70321 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxb13P70321 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxb13P70321 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Hoxb13P70321 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxb13P70321 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxb13P70321 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hoxb13P70321 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Hoxb13P70321 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxb13P70321 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxb13P70321 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxb13P70321 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxb13P70321 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxb13P70321 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxb13P70321 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxb13P70321 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxb13P70321 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxb13P70321 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxb13P70321 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxb13P70321 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxb13P70321 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxb13P70321 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxb13P70321 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxb13P70321 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxb13P70321 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxb13P70321 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxb13P70321 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxb13P70321 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxb13P70321 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxb13P70321 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxb13P70321 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxb13P70321 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxb13P70321 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxb13P70321 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxb13P70321 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxb13P70321 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxb13P70321 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxb13P70321 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxb13P70321 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxb13P70321 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxb13P70321 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxb13P70321 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxb13P70321 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxb13P70321 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxb13P70321 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxb13P70321 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxb13P70321 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxb13P70321 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms