Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkn1P70268 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkn1P70268 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkn1P70268 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkn1P70268 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkn1P70268 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkn1P70268 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkn1P70268 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkn1P70268 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkn1P70268 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkn1P70268 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkn1P70268 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkn1P70268 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkn1P70268 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkn1P70268 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkn1P70268 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkn1P70268 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkn1P70268 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkn1P70268 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkn1P70268 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkn1P70268 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkn1P70268 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkn1P70268 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkn1P70268 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkn1P70268 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkn1P70268 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkn1P70268 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkn1P70268 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkn1P70268 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkn1P70268 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkn1P70268 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkn1P70268 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkn1P70268 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkn1P70268 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkn1P70268 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkn1P70268 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkn1P70268 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkn1P70268 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pkn1P70268 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pkn1P70268 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pkn1P70268 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms