Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chl1P70232 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chl1P70232 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chl1P70232 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chl1P70232 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chl1P70232 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chl1P70232 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Chl1P70232 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chl1P70232 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Chl1P70232 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chl1P70232 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chl1P70232 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chl1P70232 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Chl1P70232 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Chl1P70232 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Chl1P70232 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chl1P70232 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chl1P70232 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Chl1P70232 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chl1P70232 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chl1P70232 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chl1P70232 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chl1P70232 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chl1P70232 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chl1P70232 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chl1P70232 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chl1P70232 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chl1P70232 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chl1P70232 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chl1P70232 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chl1P70232 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chl1P70232 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chl1P70232 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chl1P70232 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chl1P70232 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chl1P70232 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chl1P70232 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chl1P70232 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chl1P70232 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chl1P70232 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chl1P70232 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chl1P70232 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chl1P70232 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chl1P70232 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chl1P70232 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chl1P70232 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chl1P70232 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Chl1P70232 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chl1P70232 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chl1P70232 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chl1P70232 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chl1P70232 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chl1P70232 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chl1P70232 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chl1P70232 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Chl1P70232 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chl1P70232 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chl1P70232 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Chl1P70232 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chl1P70232 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chl1P70232 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chl1P70232 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chl1P70232 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chl1P70232 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chl1P70232 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chl1P70232 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chl1P70232 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chl1P70232 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chl1P70232 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Chl1P70232 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chl1P70232 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chl1P70232 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chl1P70232 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chl1P70232 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chl1P70232 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chl1P70232 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chl1P70232 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chl1P70232 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chl1P70232 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chl1P70232 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chl1P70232 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chl1P70232 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chl1P70232 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chl1P70232 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Chl1P70232 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chl1P70232 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chl1P70232 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chl1P70232 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chl1P70232 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chl1P70232 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chl1P70232 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chl1P70232 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chl1P70232 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chl1P70232 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chl1P70232 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chl1P70232 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chl1P70232 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chl1P70232 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chl1P70232 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chl1P70232 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms