Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Traf5P70191 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Traf5P70191 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Traf5P70191 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Traf5P70191 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Traf5P70191 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Traf5P70191 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Traf5P70191 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Traf5P70191 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Traf5P70191 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Traf5P70191 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Traf5P70191 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Traf5P70191 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Traf5P70191 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Traf5P70191 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Traf5P70191 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Traf5P70191 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Traf5P70191 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Traf5P70191 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Traf5P70191 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Traf5P70191 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Traf5P70191 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Traf5P70191 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Traf5P70191 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Traf5P70191 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Traf5P70191 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Traf5P70191 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Traf5P70191 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Traf5P70191 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Traf5P70191 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Traf5P70191 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Traf5P70191 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Traf5P70191 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Traf5P70191 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Traf5P70191 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Traf5P70191 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Traf5P70191 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Traf5P70191 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Traf5P70191 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Traf5P70191 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Traf5P70191 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Traf5P70191 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Traf5P70191 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Traf5P70191 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Traf5P70191 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Traf5P70191 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Traf5P70191 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Traf5P70191 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Traf5P70191 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Traf5P70191 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Traf5P70191 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Traf5P70191 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Traf5P70191 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Traf5P70191 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Traf5P70191 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Traf5P70191 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Traf5P70191 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Traf5P70191 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Traf5P70191 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Traf5P70191 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Traf5P70191 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Traf5P70191 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Traf5P70191 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Traf5P70191 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Traf5P70191 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Traf5P70191 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Traf5P70191 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Traf5P70191 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Traf5P70191 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Traf5P70191 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Traf5P70191 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Traf5P70191 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Traf5P70191 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Traf5P70191 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Traf5P70191 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Traf5P70191 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Traf5P70191 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Traf5P70191 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Traf5P70191 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Traf5P70191 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Traf5P70191 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Traf5P70191 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Traf5P70191 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Traf5P70191 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Traf5P70191 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Traf5P70191 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Traf5P70191 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Traf5P70191 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Traf5P70191 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Traf5P70191 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Traf5P70191 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Traf5P70191 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Traf5P70191 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Traf5P70191 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Traf5P70191 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Traf5P70191 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Traf5P70191 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Traf5P70191 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Traf5P70191 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Traf5P70191 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms