Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SbdsP70122 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SbdsP70122 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SbdsP70122 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SbdsP70122 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SbdsP70122 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SbdsP70122 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SbdsP70122 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms