Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkcbP68404 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PrkcbP68404 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PrkcbP68404 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrkcbP68404 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PrkcbP68404 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrkcbP68404 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PrkcbP68404 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrkcbP68404 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PrkcbP68404 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PrkcbP68404 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PrkcbP68404 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PrkcbP68404 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrkcbP68404 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrkcbP68404 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms