Protein–RNA interactions for Protein: P63163

Snrpn, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpnP63163 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SnrpnP63163 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SnrpnP63163 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SnrpnP63163 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SnrpnP63163 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SnrpnP63163 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SnrpnP63163 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SnrpnP63163 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SnrpnP63163 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SnrpnP63163 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SnrpnP63163 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SnrpnP63163 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SnrpnP63163 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SnrpnP63163 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SnrpnP63163 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SnrpnP63163 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SnrpnP63163 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SnrpnP63163 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SnrpnP63163 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SnrpnP63163 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SnrpnP63163 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SnrpnP63163 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SnrpnP63163 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SnrpnP63163 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SnrpnP63163 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SnrpnP63163 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SnrpnP63163 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms