Protein–RNA interactions for Protein: P62915

Gtf2b, Transcription initiation factor IIB, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2bP62915 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gtf2bP62915 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2bP62915 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2bP62915 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2bP62915 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2bP62915 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2bP62915 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2bP62915 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2bP62915 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2bP62915 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2bP62915 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2bP62915 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2bP62915 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2bP62915 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2bP62915 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2bP62915 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2bP62915 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2bP62915 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2bP62915 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2bP62915 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2bP62915 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2bP62915 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2bP62915 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2bP62915 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2bP62915 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2bP62915 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2bP62915 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2bP62915 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2bP62915 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2bP62915 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2bP62915 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2bP62915 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2bP62915 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2bP62915 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2bP62915 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2bP62915 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2bP62915 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2bP62915 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2bP62915 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2bP62915 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2bP62915 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2bP62915 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms