Protein–RNA interactions for Protein: P62830

Rpl23, 60S ribosomal protein L23, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23P62830 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms